Michael y Lincoln continúan luchando por proteger a Sara y Mike de amenazas peligrosas. Mientras tanto, Poseidón sigue tratando de derrotar a Michael y al resto de la pandilla, lo…

Lincoln se frustra a medida que trata de entender lo que le pasó realmente a Michael. C-Note tiene un nuevo plan de escape, pero teme que no se ejecute lo…

T-Bag advierte a Sara de que dos secuaces de Poseidón, Van Gogh y A&W, pueden estar siguiéndola. Mientras tanto, Lincoln intenta recuperar su pasaporte confiscado para escapar de Yemen, y…

Han pasado siete años desde que Michael Scofield fue dado por muerto, pero cuando varias pistas sugieren que puede que siga vivo, Lincoln Burrows se reúne con Sara Tancredi para…

Caras conocidas vuelven a ayudar a Michael en su intento por derrotar a la Compañia de una vez por todas.

La Compañía enfrenta a Lincoln, Mahone, T-Bag y Don Self contra Michael y Sara para recuperar las tarjetas de Scylla.

Don, Gretchen, Michael y la Compañia están tras Scylla. T-Bag toma como rehén a la familia de Gretchen. Michael cae en manos de la Compañia.

Michael se desmaya, y debe ingresar en un hospital; Sucre pisa una mina antipersona, y el sorprendente secreto de Trishanne es desvelado.

El equipo debe abrirse paso a través de una tubería de cien mil litros de agua para llegar a «Scylla». Mientras, T-Bag elude una investigación.

Michael y su grupo están en riesgo de volver a prisión. T-Bag utiliza una nueva identidad y ve la posibilidad de un futuro.

LJ y Whistler son intercambiados, pero abundan más sorpresas. T-Bag se convierte en el nuevo jefe de Sona.

Michael, Whistler y McGrady escapan de Sona; pero no todo sale según lo previsto. El intercambio se ve comprometido.

Susa hace un último esfuerzo para poner a Whistler lejos de Sona, y el plan hace a todos los demás prescindibles.

Alguien le ofrece un mejor trato a Mahone. Whistler es acusado de asesinato justo antes de la fuga. Entretanto, Lincoln y Sophia deben drogar al guardia.

El escape de Michael por poco funciona. Un nuevo recluso sabe algo del pasado de whistler. Por otro lado, T-Bag pierde su estatus.

Michael se enfrenta a una serie de callejones sin salida, y aprende más acerca de Whistler. Lincoln intenta rescatar a Sara y LJ.

Michael enfrenta a la presidente. Se crea una extraña alianza entre Bellick y Sucre. C-Note recibe una nueva oferta para salvar a su familia y a sí mismo.

Michael y Sara van a Henry Pope a recuperar información; un fugitivo elige entre su hija y amigos; T-Bag trae a casa a la familia Hollander.

C-Note elige entre su hija y la vida de una camarera; Kellerman resuelve el enigma de Sara; Mahone hace a Bellick y Haywire una oferta irrefutable.

Michael y Lincoln revelan su historia en televisión. Michael entrega su mensaje cifrado a Sara.

Sara se libera de su verdugo. Michael y Lincoln deciden dejar de correr y enfrentar a sus perseguidores.

Michael visita a la exesposa de Mahone. Bellick embosca a T-Bag y le pregunta por el dinero. Lincoln y LJ parecen llegar al final.

Los fugitivos halla el tesoro escondido. La Compañia investiga a Sara y a su padre. Mahone pone a Tweener la prueba definitiva.

Los hermanos llegan a Utah; Sucre se queda esperando en el altar; C-Note se lanza por su vida; el rancho Doble K no revelará sus secretos.

Mahone usa a LJ para atrapar a Lincoln y Michael; T-Bah consigue su mano; una corte pone a los hermanos frente a su perseguidor.

Michael y su grupo fuerzan a Bellick a dejar el mando al FBI; Mahone descubre los planes de Michael; T-Bah quiere que le devuelvan la mano.

Michael quiere la clave de la enfermería; Lincoln descubre que su padre ayudó a arruinar su vida; Tweener quiere escapar del abuso.

Michael se desespera en régimen de aislamiento. Sucre deja pavimentar la abertura de escape en la habitación de los guardias.

Lincoln gana dos semanas y podrá ver a su padre en la ejecución. Sucre ayuda a Michael a verificar un camino a la enfermería.

Michael no puede retrasar la ejecución de Lincoln. Verónica y Nick piden la orden de exhumación de Terence Steadman. El tiempo de Lincoln se agota.

Lincoln le advierte a Michael que alguien tendrá que quedarse. Michael llega a la enfermería. Abruzzi amenaza con matar a T-Bag.

Abruzzi convence a Michael para saber de Fibonacci; como Nick y Verónica preguntan por el dinero, el vicepresidente trae un amigote del FBI.

T-Bah pierde un esclavo y busca otro. Kellerman y Hale siguen a LJ, que intenta contactar a Verónica. Abruzzi pone en riesgo la fuga.